黄子澄以东宫旧臣参政，齐泰则需要先转为尚书。朱允炆先将茹瑺去位，方为齐泰留出了尚书正官位置。
齐黄二人遂把持权位，操纵削藩、任将、选官：
时主少国疑，诸藩与中朝互相猜贰，泰与黄子澄力赞削夺征讨之谋，特见信任焉。
齐黄二人相较，朱允炆似乎更信任黄子澄。削藩策略上，齐泰主张擒贼先擒王，先削燕王，余则不攻自破。黄子澄则主循序渐进，先剪除周代等枝叶，再图燕王;制燕策略上，齐泰主张扣留燕王三子作人质以逼迫燕王就范，黄子澄则主张放归之以释燕王之疑。最终，朱允炆都听从了黄子澄决策。
靖难战起，齐黄二人主持军政大事，走出一系列昏招。召还忠于朝廷的辽王，令宁王还朝而滋其疑、最终为燕王挟持，都失却了朱元璋晚年以藩制藩的部署策略，也令靖难战事上处于被动。
建文朝用人最大的败笔——黄子澄
齐黄还把持任将大权。耿炳文出将，自属朝野公认。有史料显示，耿炳文战死后，廷议本欲以魏国公徐辉祖往代，却临时改为李景隆，这显然出于齐黄二人的决策。召还镇守辽东的杨文，也是一着臭棋，卒使北边牵制燕王的计划，几乎归于失败。
李景隆攻北平失败，又于郑村壩大败，直接导致齐黄二人去位。建文元年末齐黄二人被罢，不过仍留京师，仍能掌握朝政。建文三年初，东昌大捷后，齐黄还朝。不数月，夹河朝廷再败，齐黄二度去位，被“阴使募兵”。齐黄第二度去位后，才真正失去了权力，方孝孺遂得参军国大政。
我推测齐黄两度去位，其原因均非简单地邀好于燕，而亦牵涉到了朝中的政争。实际上，建文朝内部反对削藩、反对齐黄秉政之声，始终不绝。齐黄去位，泰半原因，可说是被攻去。
建文元年便有尹昌隆弹劾齐黄：
京师地震，求直言。贬监察御史尹昌隆知福宁县，寻复之。尹昌隆言奸臣专政，阴盛阳衰，谪见于天，执政恶之。
“执政”、“当事”、“权臣”、“用事者”，如此词语也屡屡形诸建文史籍：
驿召汉中府教授方孝孺为翰林院博士。上素闻其贤，将大用之，为当事所忌，授博士，寻迁侍讲。
谈迁的记载融会了他的分析判断，一针见血。“当事”只能是齐黄二人，且“当事”与方孝孺并非融洽。齐黄二人不仅把持朝政，也操纵用人大权。如前所述，茹瑺去位，便是为齐泰留出位置。茹瑺也确与黄子澄有隙，以致遭攻去位：
(茹瑺)建文中，改吏部尚书，与太常卿黄子澄不协，刑部尚书暴昭党子澄，极力挤瑺，诬以赃罪，黜领河南布政使。岁中，子澄亦黜，召瑺还，复为兵部尚书。
是知黄子澄、齐泰亦有党附之人，党同伐异成为他们在人事上的作为。
解缙之贬谪河州，也属“权臣”所赐：
数岁，高皇帝上宾，公趋赴临，权臣忌公者谓赴临非诏旨，遂谪河州。岁余，权臣黜，召还，以为翰林待诏。
解缙遭贬谪和“权臣”遭罢黜相隔岁余，适与齐泰、黄子澄首度去位的时间合拍，真相大白：“权臣”为齐黄无疑。至于为何史籍多不直呼其名，我推测这与永乐而后政治忌讳有关，杨士奇如此着笔，必有深意。如同写方氏“叩头乞哀”、写耿炳文真定不死——借此抹黑方孝孺、湮灭建文史事。
齐泰和黄子澄把持了建文前两年乃至第三年的军政最高权力，这种执政态势，要到建文三年三月夹河兵败后，齐黄二度去位，方告终止。“柄国”，可称为齐黄二人在建文朝的角色。
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