但这些尚不足以精确推算出造船厂船只的准确规模，只能印证史料记载的明代海船的巨大规模。
疑问三：大号宝船只是摆设?
如果大号宝船只是摆设，那么，当年郑和乘坐的旗舰到底是什么呢?20世纪20年代，历史学家郑鹤声先生在静海寺厨房的墙壁上拓下的静海寺残碑碑文屮，多次提到官军驾乘船只中最大的是“二千料海船”。
“这种‘ 二千料海船’才是真正的下西洋旗舰。”郑明说，“料”是一种容积单位。参照明代史料记载的宁波府400和500料战船的尺度，“二千料 海船”应该长61.2米，宽13.8米。明代人宋应星在《天工开物》“舟车”中记载当时造船“凡舟身将十丈者，立桅必两。”因此“二千料海船”应为6檢木帆船。
疑问四：船队是怎样编队的?
郑和下西洋的舰船总数在48到208艘之间。郑和带领的如此庞大的船队在海上究竟如何编队航行，的确是一个值得研究探讨的问题。
航行的安全距离取决于海船的航行速度，速度越快距离应该越大，速度越小则相反。就目前的航海技术来看，海上航行时船与船之间前后左右的距离一般大约应该保持在555米。如果按当时200艘左右的船队来计划，整个船 队的编队应该在海面上占据10平方公里的面积。
由于保存下来的历史资料基本对此没有什么记载，所以给考证带来了很大的障碍。有专家推测，郑和下西洋的船队航行是鱼形编队，也有人推测说是燕形编队。但是到目前为止这些推测都不是历史学家和航海学家得出的定论，还是一个有待考证的问题。
疑问五：庞大船队如何利用风力行进?
中国古代的木制帆船以风力为航行动力，风帆一侧固定于船桅之上，航行者通过调整风帆的角度，以获得最大的风力。古代帆船在中低纬度的海面上航行，季风的作用非常重要。航海者需要对风向的季节性变化规律非常熟 悉，按照不同的季节，组织不同的航行，以最大限度地利用不同时间的盛行风，尽量达到顺风航行的目的。但是如何让如此庞大的船队都充分利用到季风，按船队的预定航线行进是很值得研究。
据北京大学历史地理研究中心邓辉博士观点，郑和下西洋先后要利用北半球的亚热带东北季风、热带东北季风，南半球的热带西北季风、热带东南季风，北半球的热带东北季风和热带西南季风，而完成这些季风转变的最短 时间是1年半，为了尽可能多地访问-些国家和地区，就盂要派遣分支船队代替主船队去访问这些国家和地区。
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