北宋时期，属于夔州路管辖，公元1102年，因赵谂谋反之事，宋徽宗以“渝”有“变”之意，改渝州为恭州。
南宋时期，宋光宗赵惇先封恭王，后即帝位，自诩双重喜庆，升恭州为重庆府，重庆由此得名。
南宋末期，蒙古军队大举南侵，公元1259年，在重庆合川打响钓鱼城之战，蒙古大汗蒙哥被流矢击中身亡，此后欧亚各战场蒙古众王回师争夺汗位，使得宋王朝延续20年，甚至改变了欧亚战场的格局。
元朝时期，立重庆路总管府，管辖四川南道宣慰司，隶属于四川行省，元朝末年，农民军明玉珍建都于此，国号大夏。
明朝时期，朱元璋灭大夏国，复改为重庆府，隶属于四川承宣布政使司，今重庆直辖市所辖地区依旧分为重庆府和夔州府。
清朝时期，今重庆直辖市所辖地区仍分为重庆府和夔州府，后又分出酉阳直隶州和忠州直隶州。公元1890年，中英签订《烟台条约续增专条》，重庆为通商口岸。
甲午战争战败后，签订《马关条约》，重庆成为第一批向日本开放的内陆通商口岸。
公元1929年，重庆正式建市，抗日战争爆发后，国民政府由南京迁至重庆，将重庆升为直辖市，为中华民国“陪都”。
1949年11月30日，重庆解放。
1953年3月，重庆改为中央直辖市。1954年7月，重庆市并入四川省，改为四川省辖市。
1997年，将原属四川省的重庆市、万县市、涪陵市、黔江地区合并设立中央直辖市。
截至2019年末，重庆辖26个区、8个县、4个自治县。
26个区分别为万州区、黔江区、涪陵区、渝中区、大渡口区、江北区、沙坪坝区、九龙坡区、南岸区、北碚区、渝北区、巴南区、长寿区、江津区、合川区、永川区、南川区、綦江区、大足区、璧山区、铜梁区、潼南区、荣昌区、开州区、梁平区、武隆区。
8个县分别为城口县、丰都县、垫江县、忠县、云阳县、奉节县、巫山县、巫溪县。
4个自治县分别为石柱土家族自治县、秀山土家族苗族自治县、酉阳土家族苗族自治县、彭水苗族土家族自治县。
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