黑竹沟由于山谷地形独特，植被茂盛，再加之雨量充沛、湿度大，所以经常是漫谷迷雾。人一旦进入这深山野谷的奇雾之中，地形又不熟，就很容易受到威胁。
当地人有这样一个顺口溜，“石门关，石门关，迷雾暗沟伴深潭;猿猴至此愁攀援，英雄难过这一关”。
这块土地上有很多野生动物和物。很多为世界稀有。有一种黑白相间，花纹成条状的大熊描和另一种黑白相间呈圆状花纹的“花熊描”更是稀有中之稀有。
在考察路上，队员们经常见到各种野生动物奔跑，晚上露宿时，都得做好严密的防范措施，以免被野生动物伤害，人们都知道大熊猫食竹子，但这里的大熊描食性不一样，经常跑到彝家山寨吃牛、羊和猪，吃完后还敢在寨子里呼呼大睡，大熊猫的食性变异有待专家去研究，这里曾有黑豹被彝族猎手捕捉过，据说这是在亚洲第一次发现黑豹，沟内还有许多活动和未被人们发现的稀有野生动物，都有侍动物专家去揭示。
这里的植物也十分丰富，百年古杉上寄生着野藤，有的直径可达3米，高达80多米，如同擎天巨扇，甚是壮观，花季来临，这里成了花的海洋，完全没有人为修饰的触痕，大自然赐给这里的是原始，古朴和宁静，众多的稀有植物，如烘桐、水青树，青檀，自辛树，银叶挂，峨眉黄莲等都属回家高等级保护种类，很有科学研究价值，有侍植物专家去研究，大面积的高山草甸是人们很难看得到的.
黑竹沟的植物起源古老，由于这里地形独特，受人类干扰极少，没有遭受第四纪冰川的袭击，故使许多古老植物得以保存下来，也给这里的植物繁衍提供了良好的自然条件。
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